Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CNIH4Q9P003 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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