Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

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Length 4,599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LRP1BQ9NZR2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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