Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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