Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAJC28Q9NX36 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms