Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SNX15Q9NRS6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SNX15Q9NRS6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SNX15Q9NRS6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SNX15Q9NRS6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SNX15Q9NRS6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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