Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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