Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRHQ9HD43 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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