Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms