Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms