Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms