Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
H2AFJQ9BTM1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2AFJQ9BTM1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms