Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms