Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms