Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms