Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRT1Q96EB6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms