Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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HDAC10Q969S8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC10Q969S8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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