Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms