Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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