Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms