Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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