Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSH2Q76I76 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSH2Q76I76 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSH2Q76I76 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSH2Q76I76 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSH2Q76I76 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSH2Q76I76 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSH2Q76I76 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSH2Q76I76 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSH2Q76I76 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSH2Q76I76 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms