Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP31Q70CQ4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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