Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUQ1

RINT1, RAD50-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RINT1Q6NUQ1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RINT1Q6NUQ1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RINT1Q6NUQ1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms