Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CREB3L3Q68CJ9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms