Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB6CQ53S08 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms