Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA8Q53HL2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms