Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKDCCQ504Y2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms