Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms