Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms