Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms