Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK4Q16099 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
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