Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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VAMP3Q15836 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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VAMP3Q15836 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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