Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms