Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNHIT3Q15649 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms