Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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