Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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RABEP1Q15276 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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RABEP1Q15276 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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