Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRKQ15262 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRKQ15262 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
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