Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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