Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
R3HDM1Q15032 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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