Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB39AQ14964 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms