Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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