Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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ERV3-1Q14264 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERV3-1Q14264 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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