Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDX39BQ13838 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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