Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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