Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms