Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms