Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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