Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 WBP1LP6-201ENST00000438434 424 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 PSG5-207ENST00000407568 1064 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AL162390.1-201ENST00000622201 1246 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
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MKRN4PQ13434 AL732372.1-203ENST00000635159 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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MKRN4PQ13434 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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MKRN4PQ13434 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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MKRN4PQ13434 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN4PQ13434 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AC114495.2-201ENST00000452686 437 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
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