Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms