Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME3Q13232 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NME3Q13232 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NME3Q13232 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME3Q13232 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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